zondag 8 maart 2015

Eggar

Omdat ik de petrischaaltjes teveel een laboratorium-uitstraling vindt hebben, heb ik een andere vorm geprobeerd. Hierbij heb ik een ei uitgehold en deze gevuld met de agar-agar basis. Deze heb ik vervolgens open gesneden om de kern eruit te halen en op te vullen met een nieuwe agar-kleur. De kern ga ik het meest aantasten d.m.v. bacteriekolonien, terwijl ik de buitenkant slechts licht of wellicht helemaal niet aan ga tasten. Als de kern helemaal klaar is, gaat deze in de ei vorm, die ik vervolgens weer dicht giet met rode agar. Het gehele ei wil ik uiteindelijk in kunststof gieten zodat de kolonie bewaard blijft zoals hij is, en niet doorgroeit.






maandag 2 maart 2015

Blood test

Om andere patronen/bacteriën te kweken heb ik een basisplaat met mijn eigen bloed gemaakt. Dit heb ik vervolgens met elektromagnetisme aangetast om te zien wat ermee gebeurt. Het uiteindelijke resultaat volgt nog aangezien het nog aan het groeien is!



zondag 18 januari 2015

Agar shapes


Toen ik bezig was met het maken van de kleine agar-platen had ik het idee dat de vorm van de platen eigenlijk niet zo interessant waren. Als test heb ik eens gekeken naar hoe het zou zijn als ik de agar in een andere vorm zou gieten. Een bol heeft voor mij tot nu toe de meeste aantrekkingskracht, en zou ook goed werken om de bacteriën uit te laten groeien. Wel zou ik dan een soort kanalen moeten maken zodat het virus zich wel verspreid over de gehele kern i.p.v. dat het als kleine kolonie blijft hangen.

Agar Agar plates


Als test wil ik zelf een aantal agar-agar platen maken. Op deze manier is het niet alleen een stuk goedkoper, ik kan dan voor toekomstige platen ook andere vormen gebruiken. Zelf zat ik al te prakkiseren over hoe ik bijv. een driedimensionale bol of kubus van agar zou kunnen maken waarbij ik een bacteriële kolonie vanuit de kern laat groeien.

Voor de eerste tests heb ik een aantal verschillende types agar gehaald. D.m.v. meerdere keren verhitten en afkoelen van de agar kun je het oplossen in water. Dit laat je vervolgens een tijd in een schaal uitharden tot het een gelatine-achtige substantie is geworden. Als de agar rond de 54° is dan moet het gelijk afgesloten worden om te voorkomen dat het zich al gaat hechten aan eventuele bacteriën die een kolonie kunnen vormen.

De agar-agar poeder die ik in een toko wist te vinden.

Na wat op het internet te hebben gespeurd kwam ik erachter dat het ook goed mogelijk is verschillende types agar te mengen, of om juist aparte delen in één schaal te combineren. Op deze manier krijg je per segment een ander type bacterie aangezien elke bacterie zo zijn eigen specifieke favoriete basisbodem opzoek. 

 Gemengde types agar in één schaal.

woensdag 14 januari 2015

Wetlab Amsterdam


 Op aanraden van Michiel ben ik gisteren naar het Wetlab in Amsterdam geweest. Dit is een lab waar vrij gewerkt wordt met o.a. de nieuwste technieken, zoals lasercutters, 3D printers, etc., maar waar ook een gedeelte gewijd is aan de biologie.

Van 17:00 tot 21:00 heb ik kunnen meekijken, rondlopen en vragen kunnen stellen over hoe ik mijn project het beste aan kan pakken en hoe ik aan materiaal zou kunnen komen. Ze konden me enkele voorbeelden laten zien van verschillende bacteriële koloniën, waaronder een aantal lichtgevende en van kleur veranderende koloniën, en uitleggen hoe je zoiets op zou kunnen zetten.

Zij gaven ook al aan dat er particulier niet gemakkelijk aan laboratoriummateriaal te komen is aangezien labs altijd grote hoeveelheden bestellen. Ook is 99% van het materiaal vrij duur voor een particulier. Zo was één pot met een 'redelijke' voedingsbasis al €800. Als alternatief gaf hij aan dat je zelf ook een basisbodem kan maken met Agar Agar, een soort zeewier. Dit is goedkoop en goed bruikbaar voor simpele kweken.


Voor petrischaaltjes hadden ze geen alternatief, die zijn vrijwel enkel per 2.000 stuks verkrijgbaar. Aangezien ze daar een hele voorraad hadden liggen mocht ik een stapel meenemen, als ik een link zou plaatsen van de website. Dus bij deze, ga zeker eens langs bij http://waag.org/nl/lab/open-wetlab :-)

donderdag 8 januari 2015

Mutation progress

Nadat ik op het idee kwam om bacteriën en/of virussen te gaan kweken ging ik gelijk op zoek naar benodigdheden. Op allerlei forums en wetenschappelijke sites probeerde ik erachter te komen wat ik nou eigenlijk nodig had, en waar ik al deze spullen zou kunnen vinden. Echter had ik geen idee wat Sphaerococcus Euchema, Gelidium en nog meer van dit soort wetenschappelijk spul was, en al helemaal niet waar ik dit zou kunnen vinden.

Van daaruit ben ik naar Micropia (Artis) geweest om te zien of ze daar wisten hoe ik aan dit soort spullen zou kunnen komen. Ze wisten helaas niet waar het voor particulieren verkrijgbaar was. Toen ik zelf op het internet aan het zoeken was of het ergens te bestellen was kwam ik er ook achter dat je petrischaaltjes, chemicaliën etc. alleen maar in bulk vanaf gemiddeld 10.000 stuks kon kopen. Wel hadden ze een mini-set waarmee je een kolonie kon kweken, dus deze heb ik ter referentie meegenomen en getest. Ook hadden ze wat tips over hoe ik de bacteriën het best zou kunnen kweken en welke voedingsbodems geschikt zijn.

Enkele kweektests in Micropia. Tof! :-)


In de tussentijd heb ik nog gekeken naar mijn eerdere idee van het combineren van een groeipatroon met het uitbreidingspatroon van een virus. Daarvoor heb ik een menselijke cel gemixt met de verplaatsingsratio en dit geanimeerd. Het abstracte beeld vind ik best lekker werken, al kan het geheel uiteraard nog sterker.



zaterdag 3 januari 2015

Mutation

Ter verdieping van het thema heb ik een stuk geschreven met zowel een persoonlijke als wetenschappelijke benadering van het woord 'Mutatie'.


Een gemuteerd babyzwijn gevonden rondom Tsjernobyl

Mutatie
(de) Mu-ta-tie (zelfst.naamw. (v.))
Afgeleid van het Latijnse ‘mutare’ (verplaatsen, veranderen, ruilen).

|.) Verandering in het erfelijk materiaal ;Plotselinge verandering in de chromosomen van levende cellen veroorzaakt door een mutagene reactie. 

Mutatie is in wetenschappelijk zin een verandering in de sequentie van de nucleotiden, oftewel de bouwstenen van DNA en RNA. Dit soort mutaties hebben invloed op de wijze waarin iets evolueert, de wijze van veroudering en het ontstaan van ziektes. Bestaan er echter ook mutaties in de vorm van gedachtegangen en denkpatronen? Ten slotte heeft de mens gedachtes gekregen door een mutatie in de prefrontale cortex, waardoor het type || neurospin proteïne ontstond. Het brein zoals wij het gebruiken is dus gevolg van een mutatie, die overigens nog steeds aan de gang is.

Sinds de opkomst van de digitale media en het internet lijkt er een cultureel geïnduceerde mutatie in ons denkpatroon te zijn ontstaan. Het lijkt er echter niet alleen op alsof mensen zich anders zijn gaan gedragen sinds de smartphone en computer voor iedereen toegankelijk werd. Kleine delen van onze hersenen en genetische structuur zijn namelijk gemuteerd door de wijze waarop we met deze media omgaan.

“Onze aandacht spanne, communicatieve vaardigheden en de mogelijkheid om abstract na tedenken sterk afgenomen doordat de patronen van de glucosemetabolisme in de orbitofrontale cortex de laatste 20 jaar vrijwel verdubbeld zijn.” (Professor Susan Greenfield, Harvard)

Doordat het er niet op lijkt dat dit fenomeen de komende tijd af zal zwakken ben ikzelf erg benieuwd hoe deze mutatie zichzelf zal gaan doorzetten, en of dit ook impact gaat hebben op ons fysieke gestel. Bij mutatie denk ik namelijk vrijwel automatisch aan zaken als Tsjernobyl, Fukushima en de nucleaire tests op Bikini Atoll. Door de straling werden er veel kinderen met verminkingen, vergroeiingen en extra ledematen geboren. Ook werd veel flora en flora aangetast, waaronder sommige vlinders geen vleugels meer aangroeiden en bomen niet meer begonnen te rotten.

Zouden onze hersenen ook een dusdanige mutatie kunnen ondergaan door een verandering in het gedachte en handelingspatroon? En zou dit tegelijkertijd invloed kunnen hebben op de rest van ons lichaam? Onze knokkels zijn namelijk ook al deels genetisch veranderd. RSI komt steeds minder voor doordat onze handen licht zijn veranderd en minder slijtage hebben ondanks dat we ze steeds meer in een herhaaldelijk patroon gebruiken. Hoe ver groeien wij naar de computer toe, en hoe dichtbij komt de computer bij ons genetische materiaal?